단일 세포 전사체 분석(Single-cell RNA Sequencing)은 개별 세포 단위로 분리하여 RNA를 증폭하고 서열분석하여 해당 세포의 전사체적 특징을 분석하는 기술입니다.
대표적인 표준화된 분석 방법으로는 세포 단위로 구분 가능한 barcode를 RNA에 결합시켜 서열분석하는 것이며, 데이터 분석 과정에서 세포 수준의 연구 결과를 확보할 수 있습니다.
면역학, 줄기세포 연구 및 암 연구 등에 광범위하게 사용됩니다.
기술의 발전을 통해 분자생물학 분야의 시퀀싱 기술과 세포 생물학 분야의 단일 세포 생물학이 접목되어 Single cell 시퀀싱 기술이 가능하게 되었습니다.
이보다 더 발전된 기술로 Single Cell 단위의 Copy Number Variants, Immune profiling 및 Antibody를 이용한 Cell Surface Protein 분석도 가능하게 되었습니다.
앞으로 단일세포 시퀀싱 기술은 암 및 각종 질환 연구에서 지금까지 해결하지 못했던 많은 문제를 해결하기 위한 최고의 솔루션으로 자리 잡을 것입니다.
1x107/mL의 cell
About 4 weeks
1x107/mL의 cell
About 4~6 weeks
| Single Cell CNV | |
| Cells per channel | 100-1000 |
| Read pairs/ cell | 750,000 |
| Reagent & Consumable | - Chromium Chip C - Chromium Chip D - Chromium Single Cell DNA Cell Bead Kit - Chromium Single Cell DNA Library and Gel Bead Kit |
| Sample type | cell |
| Read length | 2X100 or 2X150, 8bp i7 index |
| Software | Cell Ranger Analysis Pipelines Loupe scDNA Browser |
| Single Cell GE | |
| Cells per channel |
500-80,000 |
| Read pairs/ cell | 20,000 |
| Reagent & Consumable | - Chromium Chip B - Chromium Single Cell 3’ Library & Gel Bead Kit |
| Sample type | cell, nuclei |
| Read length | 28X98, 8bp i7 index |
| Software | Cell Ranger Analysis Pipelines, Loupe Cell Browser |
| Single Cell immune | |
| Cells per channel |
100-80,000 |
| Read pairs/ cell | 5,000 |
| Reagent & Consumable | - Chromium Chip A - Chromium Single Cell 5’ Library & Gel Bead Kit - Chromium Single Cell V(D)J Enrichment Kit |
| Sample type | cell |
| Read length | 2X150bp, 8bp i7 index |
| Software | Cell Ranger Analysis Pipelines, Loupe Cell Browser, Loupe V(D)J Browser |
| Single Cell ATAC | |
| Cells per channel |
500-10,000 |
| Read pairs/ cell | 25,000 |
| Reagent & Consumable | - Chromium Chip E, - Chromium Single Cell ATAC Library & Gel Bead Kit |
| Sample type | nuclei |
| Read length | 2X50, 8bp i7 index, 16bp i5 index |
| Software | Cell Ranger ATAC, Loupe Cell Browser |
2X106/mL의 cell
About 4 weeks
| 10X Genomics (scRNA) |
| - Gene Expression Profiling - Immune Profiling |
| Mission Bio (scDNA) |
| - Single Cell DNA Target Sequencing Analysis - Available Custom Panel Design |
| Data Report |
| - Cell Detection and Sequencing Summary - Clustering Analysis Summary - Clonal Variant Analysis Summary |
기술의 발전을 통해 분자생물학 분야의 시퀀싱 기술과 세포 생물학 분야의 단일 세포 생물학이 접목되어 Single cell 시퀀싱 기술이 가능하게 되었습니다.
이보다 더 발전된 기술로 Single Cell 단위의 Copy Number Variants, Immune profiling 및 Antibody를 이용한 Cell Surface Protein 분석도 가능하게 되었습니다.
앞으로 단일세포 시퀀싱 기술은 암 및 각종 질환 연구에서 지금까지 해결하지 못했던 많은 문제를 해결하기 위한 최고의 솔루션으로 자리 잡을 것입니다.
・ 1x107 cells/mL
・ About 4 weeks
・ 1x107cells/mL
・ About 4~6 weeks
| Cells per channel | Read pairs/cell | Reagent & Consumable | Sample type | Read length | Software |
| Single Cell CNV | 100-1000 | 750,000 |
| cell | 2X100 or 2X150 |
|
| Single Cell GE | 500-80,000 | 20,000 |
| cell nuclei | 28X98, 8bp i7 index |
|
| Single Cell immune | 100-80,000 | 5,000 |
| cell | 2X150bp |
|
| Single Cell ATAC | 500-10,000 | 25,000 |
| nuclei | 2X50, 8bp i7 index |
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| 10x Genomics (scRNA) |
| Data Report |
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| Mission Bio (scDNA) |
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