Microarray는 반도체칩 기술을 활용하여 유리 슬라이드와 같은 고체 평면에 많은 probe를 심어 샘플과 반응시켜 한번에 많은 유전정보를 확보하는 분석 방법입니다.
DNA, RNA 등의 정보 확보를 위해 제작되었으나, 차세대 염기서열 분석 비용의 감소로 RNA 분석의 경우 microarray 선호도는 다소 감소하는 경향인 반면,
커스텀칩 개발을 통해 DNA 분석의 경우 광범위하게 활용되고 있습니다. 대표적인 제조사로는 Thermo Fisher, Agilent, Illumina사 등이 있습니다.
| Applications | Brand | Array | Contents |
| GWAS Linkage Analysis | Affymetrix (Thermo Fisher) | Precision Medicine Research Array | 903,000 SNPs >34K for clinical-relevant variants 800K for GWAS, 49K for eQTL/Lof |
| Asian Precision Medicine Research Array | >750,000 SNPs | ||
| Axiom_KOR V 1.1 | 827,000 SNPs Korean Biobank Array | ||
| Genome-Wide Human SNP Array 6.0 | 906,600 SNPs + 946,000 CNV probes | ||
| Axiom® Exome 319 Array Plate | 319,000 SNPs | ||
| Axiom® Genome 319 Array Plate | 598,375 SNPs | ||
| Pharmacogenomics | Affymetrix (Thermo Fisher) | DMET™ | 1,936 SNPs |
| Pharmacoscan | 4,627 SNPs 96 format, 24 format | ||
| Cytogenetics | Affymetrix (Thermo Fisher) | CytoscanHD Array | 749,157 SNPs + 2,696,550 CN probesf |
| OncoScan® CNV FFPE Assay Kit | Copy number solution for FFPE Samples(~900genes) | ||
| Agilent | aCGH | 1 x 1M, 2 x 400K, 4 x 180K, 8 x 60k |
| SNP Array |
| - Gender,Call rate, Hetero rate, QC, IBS test Summary - GWAS(Genome-Wide Association Study) Analysis - Aberration Summary - Detection, Amplification, Deletion and LOH |
